服务器正常运行后，可以配置垃圾邮件过滤和病毒邮件防护了。
1、配置垃圾邮件过滤
在hmailserver的设置=>反垃圾邮件中，设置垃圾邮件门槛，默认为5，可以设置添加[SPAM]字段至邮件主题。设置垃圾邮件删除门槛，根据自己需求，若垃圾邮件很多，建议设10-15. 也可以将需要的邮箱或域添加到白名单中。
垃圾邮件测试选项中，可以选择检测SPF、校验命令主机名、校验发送者是否有DNS-MX记录。
如要更严谨的过滤垃圾邮件，需要用到一个外部工具Spam Assassin for Win32，官方网站http://spamassassin.apache.org/，该程序是一个免费的功能强大的垃圾邮件过滤工具。支持网上垃圾邮件数据库DCC（http://www.rhyolite.com/anti-spam/dcc/）和Cloudmark（http://razor.sf.net/）的垃圾邮件列表。
使用很简单，运行spamd.exe即可，该程序无运行界面工作在后台，通过任务管理器可以看到，退出也需要用任务管理器结束。点击Spam Assassin，选择使用Spam Assassin，评分也选择使用Spam Assassin。点击测试，检查Spam Assassin运行是否正常。
Spam Assassin for Win32下载地址：http://disk.epcboy.com/viewfile.php?file_id=23
下面是测试反馈界面，说明程序运行正常：
在反垃圾邮件中有RBL和SURBL列表，RBL是英文Real time Black hole List的缩写，即实时黑名单列表。该列表实时更新，因此能够保证过滤最新垃圾邮件。默认有二个RBL服务器zen.spamhaus.org，bl.spamcop.net，再手动添加一个国内反垃圾邮件组织cbl.anti-spam.org.cn服务器，全部启用。给邮件评分，评分越高越接近垃圾邮件，若垃圾邮件比较多，将评分设置的高些，如3-5.
保存后你的邮件服务器就拥有很强劲的实时更新的垃圾邮件过滤功能了。
2、配置防病毒邮件功能。
在常规中根据需要选择发现病毒时的操作。配置病毒扫描软件，我用的是hMailServer推荐的Clam Win免费杀毒软件。
Clam Win免费杀毒软件，号称最低功耗的“静音杀毒软件”。它占用资源非常小，拥有排程扫描、在线更新病毒码、及时侦测等功能，而且是一款基于 GPL 许可证的自由软件。 hMailServer对Clam Win非常友好，安装好Clam Win后点击Auto-Detect按钮即可自动加入参数，无需手工填写。
Clam Win 0.97.2杀毒软件，下载地址：http://disk.epcboy.com/viewfile.php?file_id=14
这样就可以使hMailServer拥有病毒邮件防护功能了。
hMailServer收到病毒邮件会自动删除并发邮件通知收件人，内容如下：
至此，hMailServer的垃圾邮件过滤及病毒邮件防护功能配置完成，一台完整的功能强劲的邮件服务器搭建完毕。